К созданию Архангельского музея деревянного зодчества Борис Гнедовский приступил в 1961 году. В 1968 году он докладывал в Министерстве культуры РСФСР свои предложения по общей концепции музея и предварительному генплану: «На географической карте отчетливо видно, как территорию Архангельской области, равную по площади нескольким европейским государствам, рассекают синие полосы. Это великие северные реки: Онега, Северная Двина, с притоками Пинегой и Вагой, Мезень, Печора. Разделенные глухими лесами, земли вдоль течения этих рек веками находились в условиях естественной природной изоляции. Славянские поселенцы, выходцы из Новгорода, Ростова, Твери, Москвы принесли в этот суровый край свои обычаи, технические навыки, свою художественную культуру. Сложились отдельные архитектурно-художественные школы. Они развивались в общем русле древнерусского искусства, но каждая имела свои местные особенности... Именно это разнообразие архитектурных форм различных регионов и определяет структуру музея. Он разделен на секторы...»
В 1975 году совместно с О. Г. Севан Борис Гнедовский разработал уточненный генеральный план, ставший основой проектов детальной планировки отдельных секторов. Как вспоминает Ольга Георгиевна Севан, «обладая профессиональными качествами в области реставрации, порядочностью и несомненным обаянием, он (Борис Гнедовский) был не только руководителем мастерской, но и наставником для своих подчиненных».
«В нашем понимании музеи под открытым небом — это прежде всего музеи архитектуры, которые образуют прекрасную среду для организации пространства многогранных проявлений духовной и материальной народной культуры. В ансамбле произведений крестьянских зодчих, резчиков, художников, а также предметов прикладного искусства — бытовой и художественной утвари — роль зодчества особенно весома. Оно ведет заглавную тему музея, отнюдь не подавляя и не заглушая другие его голоса», — эти слова Бориса Гнедовского напрямую относятся к музею «Малые Корелы».
